MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidiphilium cryptum JF-5 plasmid pACRY03

Total Repeats: 1772

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_009469	ATCG	2	8	50290	50297	25 %	25 %	25 %	25 %	148244022
1002	NC_009469	CG	3	6	50305	50310	0 %	0 %	50 %	50 %	148244022
1003	NC_009469	GCT	3	9	50333	50341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244022
1004	NC_009469	CAGC	2	8	50349	50356	25 %	0 %	25 %	50 %	148244022
1005	NC_009469	GGC	2	6	50400	50405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244022
1006	NC_009469	GCA	2	6	50412	50417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244022
1007	NC_009469	GGGAA	2	10	50455	50464	40 %	0 %	60 %	0 %	148244022
1008	NC_009469	TGG	2	6	50489	50494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148244022
1009	NC_009469	CCCG	2	8	50532	50539	0 %	0 %	25 %	75 %	148244022
1010	NC_009469	GT	3	6	50730	50735	0 %	50 %	50 %	0 %	148244023
1011	NC_009469	TCC	2	6	50747	50752	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148244023
1012	NC_009469	GAT	2	6	50807	50812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148244023
1013	NC_009469	TCA	2	6	50839	50844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148244023
1014	NC_009469	CAG	2	6	50961	50966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244023
1015	NC_009469	GGA	2	6	51004	51009	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148244023
1016	NC_009469	TTG	2	6	51077	51082	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148244023
1017	NC_009469	GCCG	2	8	51122	51129	0 %	0 %	50 %	50 %	148244023
1018	NC_009469	CGC	2	6	51247	51252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244023
1019	NC_009469	AGCA	2	8	51344	51351	50 %	0 %	25 %	25 %	148244023
1020	NC_009469	CGA	2	6	51377	51382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244023
1021	NC_009469	GAAT	2	8	51392	51399	50 %	25 %	25 %	0 %	148244023
1022	NC_009469	ATC	2	6	51401	51406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148244023
1023	NC_009469	TGCGC	2	10	51417	51426	0 %	20 %	40 %	40 %	148244023
1024	NC_009469	CAA	2	6	51447	51452	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148244023
1025	NC_009469	GGC	2	6	52051	52056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244024
1026	NC_009469	ACA	2	6	52101	52106	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148244024
1027	NC_009469	CAC	2	6	52246	52251	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148244024
1028	NC_009469	CGGG	2	8	52277	52284	0 %	0 %	75 %	25 %	148244024
1029	NC_009469	GCC	2	6	52329	52334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244024
1030	NC_009469	GGC	2	6	52336	52341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244024
1031	NC_009469	ACA	2	6	52365	52370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148244024
1032	NC_009469	TGT	2	6	52435	52440	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148244024
1033	NC_009469	CCG	2	6	52455	52460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244024
1034	NC_009469	TCA	2	6	52490	52495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148244024
1035	NC_009469	CCT	2	6	52497	52502	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148244024
1036	NC_009469	GCCT	2	8	52516	52523	0 %	25 %	25 %	50 %	148244024
1037	NC_009469	GGCT	2	8	52552	52559	0 %	25 %	50 %	25 %	148244024
1038	NC_009469	CCAG	2	8	52733	52740	25 %	0 %	25 %	50 %	148244025
1039	NC_009469	TCC	2	6	52762	52767	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148244025
1040	NC_009469	CCG	2	6	52771	52776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244025
1041	NC_009469	GGC	2	6	52800	52805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244025
1042	NC_009469	CAT	2	6	52820	52825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148244025
1043	NC_009469	ACA	2	6	52828	52833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148244025
1044	NC_009469	GGCT	2	8	52938	52945	0 %	25 %	50 %	25 %	148244025
1045	NC_009469	CGGC	2	8	52948	52955	0 %	0 %	50 %	50 %	148244025
1046	NC_009469	CTGGTG	2	12	52956	52967	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	148244025
1047	NC_009469	GCG	2	6	53002	53007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244025
1048	NC_009469	CGC	2	6	53048	53053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244026
1049	NC_009469	GTG	2	6	53097	53102	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148244026
1050	NC_009469	ATC	2	6	53103	53108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148244026
1051	NC_009469	CGC	2	6	53114	53119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244026
1052	NC_009469	TGC	2	6	53164	53169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244026
1053	NC_009469	GC	3	6	53184	53189	0 %	0 %	50 %	50 %	148244026
1054	NC_009469	GGGGC	2	10	53278	53287	0 %	0 %	80 %	20 %	148244026
1055	NC_009469	CAG	2	6	53316	53321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244026
1056	NC_009469	CGC	2	6	53496	53501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244027
1057	NC_009469	GGGGC	2	10	53584	53593	0 %	0 %	80 %	20 %	148244027
1058	NC_009469	C	6	6	53711	53716	0 %	0 %	0 %	100 %	148244027
1059	NC_009469	GGCG	2	8	53736	53743	0 %	0 %	75 %	25 %	148244027
1060	NC_009469	CCG	2	6	53798	53803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244027
1061	NC_009469	AGG	2	6	53822	53827	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148244027
1062	NC_009469	ATG	2	6	53861	53866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148244027
1063	NC_009469	GCC	2	6	53890	53895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244027
1064	NC_009469	CGG	2	6	53954	53959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244027
1065	NC_009469	GCC	2	6	53992	53997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244027
1066	NC_009469	CG	3	6	54010	54015	0 %	0 %	50 %	50 %	148244027
1067	NC_009469	GCC	2	6	54023	54028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244027
1068	NC_009469	ATG	2	6	54119	54124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148244027
1069	NC_009469	GGT	2	6	54147	54152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148244027
1070	NC_009469	CACG	2	8	54175	54182	25 %	0 %	25 %	50 %	148244027
1071	NC_009469	GCC	2	6	54214	54219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244027
1072	NC_009469	CAC	2	6	54316	54321	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148244027
1073	NC_009469	GAG	2	6	54352	54357	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148244027
1074	NC_009469	GGC	2	6	54403	54408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244027
1075	NC_009469	GTC	2	6	54409	54414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244027
1076	NC_009469	AG	3	6	54420	54425	50 %	0 %	50 %	0 %	148244027
1077	NC_009469	CCGG	2	8	54483	54490	0 %	0 %	50 %	50 %	148244027
1078	NC_009469	CAC	2	6	54498	54503	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148244027
1079	NC_009469	CG	3	6	54542	54547	0 %	0 %	50 %	50 %	148244027
1080	NC_009469	GC	3	6	54580	54585	0 %	0 %	50 %	50 %	148244027
1081	NC_009469	CAC	2	6	54591	54596	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148244027
1082	NC_009469	CTG	2	6	54697	54702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244027
1083	NC_009469	GC	3	6	54727	54732	0 %	0 %	50 %	50 %	148244027
1084	NC_009469	GGT	2	6	54741	54746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148244027
1085	NC_009469	TTC	2	6	54748	54753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148244027
1086	NC_009469	GCG	2	6	54767	54772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244027
1087	NC_009469	CGG	2	6	54792	54797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244027
1088	NC_009469	TGG	2	6	54806	54811	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148244027
1089	NC_009469	AGGGC	2	10	54814	54823	20 %	0 %	60 %	20 %	148244027
1090	NC_009469	ACA	2	6	54857	54862	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148244027
1091	NC_009469	CCCG	2	8	54933	54940	0 %	0 %	25 %	75 %	148244027
1092	NC_009469	CTG	2	6	54976	54981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244027
1093	NC_009469	GC	4	8	55055	55062	0 %	0 %	50 %	50 %	148244027
1094	NC_009469	TGA	2	6	55116	55121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148244027
1095	NC_009469	GCC	2	6	55238	55243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244027
1096	NC_009469	TGT	2	6	55250	55255	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148244027
1097	NC_009469	GTG	2	6	55345	55350	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148244027
1098	NC_009469	GAA	2	6	55453	55458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148244027
1099	NC_009469	CCG	2	6	55487	55492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244027
1100	NC_009469	TGC	2	6	55520	55525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244027
1101	NC_009469	TCA	2	6	55544	55549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148244027
1102	NC_009469	GGC	2	6	55558	55563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244027
1103	NC_009469	ATC	2	6	55570	55575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148244027
1104	NC_009469	TCG	2	6	55604	55609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244027
1105	NC_009469	CCAC	2	8	55661	55668	25 %	0 %	0 %	75 %	148244027
1106	NC_009469	CGA	2	6	55671	55676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244027
1107	NC_009469	CGG	2	6	55679	55684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244027
1108	NC_009469	AGG	2	6	55730	55735	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148244027
1109	NC_009469	CACC	2	8	55802	55809	25 %	0 %	0 %	75 %	148244028
1110	NC_009469	AGC	2	6	55877	55882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244028
1111	NC_009469	CTC	2	6	56052	56057	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148244028
1112	NC_009469	GCTC	2	8	56075	56082	0 %	25 %	25 %	50 %	148244028
1113	NC_009469	CAA	2	6	56086	56091	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148244028
1114	NC_009469	CGGC	2	8	56120	56127	0 %	0 %	50 %	50 %	148244028
1115	NC_009469	ACG	2	6	56266	56271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244028
1116	NC_009469	CAG	2	6	56275	56280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244028
1117	NC_009469	GAG	2	6	56371	56376	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148244028
1118	NC_009469	AGC	2	6	56394	56399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244028
1119	NC_009469	GCG	2	6	56420	56425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244028
1120	NC_009469	GCG	2	6	56447	56452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244028
1121	NC_009469	CGG	2	6	56466	56471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244028
1122	NC_009469	AAT	2	6	56725	56730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148244029
1123	NC_009469	CGG	2	6	56832	56837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244029
1124	NC_009469	TCA	2	6	56874	56879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148244029
1125	NC_009469	ATG	2	6	56894	56899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148244029
1126	NC_009469	GTG	2	6	56954	56959	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148244029
1127	NC_009469	ATT	2	6	56963	56968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	148244029
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1131	NC_009469	ATCTC	2	10	57237	57246	20 %	40 %	0 %	40 %	148244029
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1134	NC_009469	CTG	2	6	57287	57292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244029
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1144	NC_009469	AACG	2	8	57834	57841	50 %	0 %	25 %	25 %	148244030
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1251	NC_009469	TTC	2	6	61944	61949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148244035
1252	NC_009469	GAT	2	6	61964	61969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148244035
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1255	NC_009469	TCA	2	6	62077	62082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148244035
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1392	NC_009469	CA	3	6	67818	67823	50 %	0 %	0 %	50 %	148244039
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